studierte in Paris bei Jean Langlais, der ihm 1979 eine seiner Orgelkompositionen (Noël N°3 avec variations) widmete. Als Assistent begleitete er Langlais regelmäßig auf Tourneen und spielte mit ihm mehrere Konzerte zu vier Händen und vier Füßen. Weitere Studien bei André Marchal, Marie-Claire Alain, Jean Guillou, Guy Bovet und Lionel Rogg.
1982 errang er den Premier Prix d’Honneur à l’unanimité beim Internationalen Wettbewerb in Paris, ebenso den Premier Prix d’orgue am Conservatoire National Supérieur de Musique in Paris.
Daniel Maurer ist Titularorganist an der J.-A.-Silbermann-Orgel der Straßburger St.-Thomas-Kirche. Er lehrt als Professor für Orgel und Improvisation am Conservatoire und an der Académie Supérieure de Musique (Musikhochschule, HEAR) in Straßburg.